تضم مكتبة المركز العديد من الكتب وفي مجالات متنوعة تشكل الشرعية منها الركن الأساسي حيث كتب التفسير والعقيدة والحديث النبوي الشريف والفقه وأصوله والسيرة واللغة والتاريخ وهذا فضلاً عن الكتب عامة والدوريات المتنوعة والنشرات الصادرة من المؤسسات العلمية والثقافية

هذا والعمل جاري الآن لعمل فهرسة وتصنيف جديدين للمكتبة مع السعي لإضافة مصادر جديدة لجعل المكتبة تلبي أكبر قدر ممكن من متطلبات الباحثين والمثقفين وطلبة العلم

كما تضم المكتبة قاعتان مجهزتان للإنترنت وهي متاحة لكل راغب بالعمل البحثي والتواصل المعرفي إذ هناك قاعة للرجال وأخرى للنساء والاستخدام مجاني لزوار وأعضاء المركز

نظام المكتبة:

إن مكتبة المركز مفتوحة أمام كل الزوار وطلبة العلم حيث المطالعة الداخلية وإمكانية الاستنساخ للجزء المطلوب من أي كتاب مع توفير كافة الخدمات التي يحتاجها الباحثين مع إمكانية استخدام الإنترنت داخل المكتبة.

إن من أهم خصائص مكتبة المركز توفير أماكن خاصة للباحثين الراغبين بالتفرغ للبحث (خلوات علمية) حيث توجد صالات خاصة لهذا الأمر داخل المركز وتتوفر فيها المستلزمات العلمية البحثية من جهاز حاسوب مع طاولة وخزانة لكل باحث وهذه خاصية نادرة تنفرد بها مكتبة المركز

نظام البحث بالمكتبة:

يمكن لأي راغب بالبحث عن كتاب ما أو أية إصدارات لمؤلف معين أن يجد بغيته في مكتبة المركز سواء عن طريق الموقع على الإنترنت أم عند تواجده في مكتبة المركز، وذلك من خلال قاعدة البيانات المعدَّة لذلك حيث تضغط على ctrl+f وبعدها يتم إدخال اسم الكتاب أو المؤلف لتستلم النتيجة إن كان الكتاب أو المؤلف موجوداً أم لا.

هذا والعمل جاري لعمل إضافات فنية أخرى في سبيل تيسير عملية الاستفادة من المكتبة وصولاً للمبتغى بأيسر الطرق.